ภารกิจและอำนาจหน้าที่ ดังนี้

(1) ศึกษา วิเคราะห์ และจัดทำข้อเสนอแนะเชิงนโยบายและมาตรการในเขตเกษตรเศรษฐกิจและพื้นที่เฉพาะ
(2) จัดทำแนวทาง แผนงาน/โครงการ การบริหารจัดการเขตเกษตรเศรษฐกิจ
(3) ประสาน อำนวยการในการบริหารจัดการการเกษตรในพื้นที่เศรษฐกิจเฉพาะ
(4) บูรณาการแผนงานการดำเนินโครงการบริหารจัดการเขตเกษตรเศรษฐกิจร่วมกับหน่วยงานที่เกี่ยวข้อง
(5) ปฏิบัติงานอื่นใดตามที่ได้รับมอบหมาย